Sandra Küpper studierte Theaterwissenschaften, Germanistik und Journalistik an den Universitäten in Leipzig und Wien sowie Dramaturgie an der Universität Hamburg. Von 2006 bis 2009 ist sie Dramaturgin am Schauspielhaus Graz, von 2009 bis 2017 am Thalia Theater in Hamburg - ihr Fokus ist hier die Internationalisierung des Stadttheaters. Sie leitet in dieser Zeit das internationale Festival "Um alles in der Welt – Lessingtage" und arbeitet mit Regisseur·innen wie Kornél Mundruczó, Ene-Liis Semper und Tiit Ojasoo, Christiane Jatahy sowie mit Antú Romero Nunes, Christopher Rüping, Christiane Pohle, Bernadette La Hengst und Luk Perceval zusammen. 2017 verantwortet sie gemeinsam mit Amelie Deuflhard, András Siebold und Joachim Lux das künstlerische Programm des Festivals "Theater der Welt" in Hamburg. Von 2018 bis 2021 ist sie Stellvertretende Intendantin am Luzerner Theater und für die künstlerische Leitung des Schauspiels verantwortlich. An diesem Haus arbeitet sie mit einem internationalen Team und Regisseur·innen wie Kornél Mundruczó, Ene-Liis Semper und Tiit Ojasoo, Angeliki Papoulia und Christos Passalis, Christophe Meierhans, Thomas Verstraeten, Giacomo Veronesi und Franz von Strolchen. Ab Ende 2022 leitet Sandra Küpper den Bereich für globale Kontakte und Initiativen der Schweizer Kulturstiftung Pro Helvetia und arbeitet eng mit allen von Pro Helvetia geförderten Disziplinen sowie mit den Verbindungsbüros in Südamerika, Kairo, Johannesburg, Shanghai, Neu-Delhi und Moskau zusammen.
Als freie Dramaturgin ist sie zuletzt u.a. mit der Regisseurin Rieke Süßkow am Akademietheater Wien (Zwiegespräch von Peter Handke, eingeladen zum Berliner Theatertreffen und zum Festival Radikal jung in München) zu Gast und entwirft gemeinsam mit Franz von Strolchen das Konzept zu Boji, einer installativen Performance, die am Theater am Lend in Graz entsteht. Mit „Orestie I-IV“ in der Inszenierung von Nicolas Stemann kehrt sie als Gast ans Thalia zurück.